1982年创刊
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ISSN 1008-3847
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CN 44-1202/S
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本期杂志
2024年12期
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面向生产,而向基层,面向农村;
以普及为主,兼顾提高;
以实用为主,兼顾基础理论;
立足广东,流通全国,走向世界。
养禽与禽病防治
2023年第12期
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原阿片碱对鸡卵巢组织的作用靶点分析
孔研
( 湖南农业大学动物医学院 , 湖南 , 长沙 410128 )
刘伟
( 湖南农业大学动物医学院 , 湖南 , 长沙 410128 )
柳亦松
( 湖南农业大学动物医学院 , 湖南 , 长沙 410128 )
中图分类号:S859.1
文献标志码:A
文章编号:1008-3847(2023)12-0002-10
摘要:
本论文采用了网络药理学的方法,以原阿片碱 ( Protopine ) 为研究对象,探究其在鸡卵巢组织中的作用靶点。通过反向分子对接网站 SwissTarget Prediction 筛选原阿片碱对应的靶点,通过检索 NCBI 和 GeneCards 数据库收集与鸡卵巢组织炎症相关的靶点,进而得到原阿片碱治疗家禽卵巢炎症的关键靶点 ;将获得的关键靶点导入 STRING 数据库进行分析,并构建蛋白质 - 蛋白质相互作用 ( protein-protein interaction,PPI ) 网络,通过Cytoscape 软件可视化 ;通过 STRING 数据库对关键靶点进行基因本体 ( gene ontology,GO ) 功能及京都基因与基因组百科全书 ( Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG ) 通路富集分析。共筛选得到原阿片碱的 42 个相关的靶点,与 2 489 个鸡卵巢组织相关靶点取交集,获得 17 个交集靶点。PPI 网络分析显示,MAPK8、CHEK1、PIK3CA、PTGS2、JAK1、JAK3、JAK2、PIK3CB、PIK3CD、CCNE1、CDK2、APP、TYMS 和CYP19A1 这些基因可能为原阿片碱治疗鸡卵巢炎症的关键靶点;KEGG 通路富集分析得到炎症途径和凋亡相关途径信号通路。通过基因数据库的分析,预测出了可能与原阿片碱相关的基因、蛋白质、信号通路等,对于原阿片碱产品的临床的使用有较好的指导意义。
关键字:
原阿片碱 鸡卵巢 网络药理学
责任编辑: 孙坚